Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RTN1Q16799 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RTN1Q16799 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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