Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CARTPTQ16568 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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