Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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DDB1Q16531 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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DDB1Q16531 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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DDB1Q16531 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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DDB1Q16531 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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DDB1Q16531 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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DDB1Q16531 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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DDB1Q16531 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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