Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK5Q16478 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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GRIK5Q16478 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK5Q16478 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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