Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
E2F4Q16254 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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