Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC85BQ15834 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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