Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIX1Q15475 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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