Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLD3Q15054 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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