Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NR1D2Q14995 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NR1D2Q14995 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms