Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSPNQ14714 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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