Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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CKAP5Q14008 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CKAP5Q14008 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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