Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2H3Q13889 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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