Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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NAE1Q13564 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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NAE1Q13564 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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NAE1Q13564 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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NAE1Q13564 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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NAE1Q13564 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NAE1Q13564 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAE1Q13564 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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