Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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