Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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