Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF1Q13077 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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TRAF1Q13077 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRAF1Q13077 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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