Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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