Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PTPN13Q12923 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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