Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LMAN2Q12907 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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