Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms