Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TFF3Q07654 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TFF3Q07654 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TFF3Q07654 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TFF3Q07654 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TFF3Q07654 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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