Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CALD1Q05682 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CALD1Q05682 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms