Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.33□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
IFITM3Q01628 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
IFITM3Q01628 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms