Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKD1P98161 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKD1P98161 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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