Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HBBP68871 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HBBP68871 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HBBP68871 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HBBP68871 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HBBP68871 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HBBP68871 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms