Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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