Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
HERVK_113P61574 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms