Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
FAM3BP58499 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
FAM3BP58499 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms