Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FBXW4P57775 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXW4P57775 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms