Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TPTEP56180 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TPTEP56180 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TPTEP56180 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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