Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH15P55291 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH15P55291 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms