Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTTPP55157 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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