Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPAP49450 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPAP49450 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms