Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KRT6CP48668 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KRT6CP48668 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms