Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NSG1P42857 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NSG1P42857 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NSG1P42857 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms