Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR2AP28223 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR2AP28223 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms