Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TCEA1P23193 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms