Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
EPCAMP16422 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms