Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MCF2P10911 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MCF2P10911 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MCF2P10911 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MCF2P10911 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MCF2P10911 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCF2P10911 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms