Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NR2F1P10589 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NR2F1P10589 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms