Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IGKV1-13P0DP09 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms