Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SRPRAP08240 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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