Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFLP07196 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFLP07196 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NEFLP07196 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFLP07196 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFLP07196 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEFLP07196 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms