Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CBX7O95931 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX7O95931 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX7O95931 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 561.5 ms