Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SCN2BO60939 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SCN2BO60939 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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