Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNC1O60486 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNC1O60486 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms