Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BCKDKO14874 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms