Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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LINC00587B1AMM8 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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LINC00587B1AMM8 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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LINC00587B1AMM8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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LINC00587B1AMM8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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LINC00587B1AMM8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00587B1AMM8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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LINC00587B1AMM8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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LINC00587B1AMM8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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LINC00587B1AMM8 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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LINC00587B1AMM8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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LINC00587B1AMM8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00587B1AMM8 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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