Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRAMEF25A6NGN4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF25A6NGN4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms