Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAXBP1Q9Y5B6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms